SMP IT Imam Syafii 2 Pekanbaru memiliki Program-program Unggulan yakni :
- Program Tilawah Tahfidz dengan rincian : Boarding 6 Juz dan Fullday 3 Juz
- Sholat Berjamaah Zuhur dan Ashar
- Sholat Sunnah Dhuha
- Dzikir Pagi-petang
- Lintas Alam dan Diklat Pramuka Kelas 7
- Outing Class Kelas 8
- Rihlah Akbar Kelas 9
- Arabic Day
- English Day
- Muhadhoroh
- Imsya Berbagi
- Home Visit
- Jumat Sehat
- Kajian Rutin Siswa
- Ekstrakurikuler (Panah, Futsal, Basket, Badminton dan Komputer Multimedia)