SMP IT Imam Syafii 2 Pekanbaru memiliki Program-program Unggulan yakni :
- Program Tilawah Tahfidz dengan rincian : Boarding 6 Juz dan Fullday 3 Juz
- Karangtina Bahasa Arab dan Arabic Day
- Rihlah Akbar
- Majelis Ilmu Syari Siswa
- Dayli Sunnah
- Ekstrakurikuler